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La optimización, el escalamiento y la estimación de parámetros son problemas inversos que aparecen en muchos procesos biotecnológicos. En la solución de los problemas inversos se han utilizado diferentes técnicas, entre ellas los algoritmos metaheurísticos. Estos algoritmos buscan y encuentran de manera eficiente buenas soluciones a un determinado problema, con un costo computacional razonable. En este trabajo se aplican cuatro algoritmos metaheurísticos bien conocidos (Algoritmo Genético, Evolución Diferencial, Optimización por Colonia de Hormigas y Optimización por Enjambre de Partículas) al problema de estimar parámetros en el proceso de cromatografía líquida en columna. Se analiza la efectividad de cada método, realizando una comparación basada en diferentes criterios estadísticos. El procedimiento utilizado permite obtener valores cercanos a los parámetros reales, con un buen ajuste de las curvas generadas por el modelo a los datos experimentales. El algoritmo que obtiene mejores resultados es Evolución Diferencial.